Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GFRA3O60609 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA3O60609 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GFRA3O60609 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFRA3O60609 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFRA3O60609 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFRA3O60609 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFRA3O60609 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFRA3O60609 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GFRA3O60609 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFRA3O60609 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GFRA3O60609 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GFRA3O60609 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFRA3O60609 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFRA3O60609 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA3O60609 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA3O60609 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA3O60609 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA3O60609 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms