Protein–RNA interactions for Protein: O60516

EIF4EBP3, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP3O60516 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIF4EBP3O60516 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIF4EBP3O60516 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIF4EBP3O60516 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIF4EBP3O60516 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIF4EBP3O60516 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIF4EBP3O60516 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIF4EBP3O60516 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIF4EBP3O60516 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIF4EBP3O60516 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIF4EBP3O60516 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EIF4EBP3O60516 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIF4EBP3O60516 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIF4EBP3O60516 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIF4EBP3O60516 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIF4EBP3O60516 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIF4EBP3O60516 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EIF4EBP3O60516 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIF4EBP3O60516 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EIF4EBP3O60516 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EIF4EBP3O60516 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EIF4EBP3O60516 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EIF4EBP3O60516 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EIF4EBP3O60516 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EIF4EBP3O60516 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EIF4EBP3O60516 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EIF4EBP3O60516 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EIF4EBP3O60516 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EIF4EBP3O60516 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EIF4EBP3O60516 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EIF4EBP3O60516 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EIF4EBP3O60516 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EIF4EBP3O60516 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EIF4EBP3O60516 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EIF4EBP3O60516 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EIF4EBP3O60516 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EIF4EBP3O60516 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EIF4EBP3O60516 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EIF4EBP3O60516 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms