Protein–RNA interactions for Protein: O60443

DFNA5, Non-syndromic hearing impairment protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFNA5O60443 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DFNA5O60443 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DFNA5O60443 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms