Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TLX3O43711 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TLX3O43711 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TLX3O43711 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TLX3O43711 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TLX3O43711 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TLX3O43711 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TLX3O43711 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TLX3O43711 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TLX3O43711 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TLX3O43711 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TLX3O43711 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TLX3O43711 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TLX3O43711 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TLX3O43711 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TLX3O43711 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TLX3O43711 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TLX3O43711 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TLX3O43711 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TLX3O43711 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TLX3O43711 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TLX3O43711 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TLX3O43711 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TLX3O43711 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TLX3O43711 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TLX3O43711 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TLX3O43711 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLX3O43711 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLX3O43711 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLX3O43711 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLX3O43711 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLX3O43711 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLX3O43711 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLX3O43711 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TLX3O43711 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLX3O43711 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLX3O43711 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLX3O43711 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLX3O43711 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLX3O43711 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLX3O43711 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLX3O43711 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLX3O43711 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLX3O43711 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLX3O43711 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TLX3O43711 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TLX3O43711 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLX3O43711 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLX3O43711 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLX3O43711 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLX3O43711 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLX3O43711 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TLX3O43711 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TLX3O43711 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TLX3O43711 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TLX3O43711 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TLX3O43711 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TLX3O43711 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TLX3O43711 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TLX3O43711 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TLX3O43711 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TLX3O43711 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLX3O43711 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLX3O43711 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLX3O43711 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLX3O43711 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLX3O43711 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLX3O43711 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLX3O43711 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLX3O43711 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLX3O43711 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TLX3O43711 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TLX3O43711 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TLX3O43711 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TLX3O43711 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TLX3O43711 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TLX3O43711 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TLX3O43711 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TLX3O43711 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TLX3O43711 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TLX3O43711 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TLX3O43711 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TLX3O43711 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TLX3O43711 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TLX3O43711 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLX3O43711 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TLX3O43711 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLX3O43711 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLX3O43711 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLX3O43711 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLX3O43711 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLX3O43711 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TLX3O43711 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TLX3O43711 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TLX3O43711 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TLX3O43711 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLX3O43711 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLX3O43711 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLX3O43711 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TLX3O43711 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms