Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SPRY3O43610 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SPRY3O43610 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms