Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAD51CO43502 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD51CO43502 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAD51CO43502 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms