Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERI3O43414 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERI3O43414 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERI3O43414 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERI3O43414 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERI3O43414 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERI3O43414 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERI3O43414 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERI3O43414 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERI3O43414 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERI3O43414 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERI3O43414 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERI3O43414 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERI3O43414 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERI3O43414 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERI3O43414 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERI3O43414 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERI3O43414 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERI3O43414 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERI3O43414 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERI3O43414 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERI3O43414 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ERI3O43414 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ERI3O43414 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ERI3O43414 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERI3O43414 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERI3O43414 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERI3O43414 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERI3O43414 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERI3O43414 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERI3O43414 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERI3O43414 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERI3O43414 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERI3O43414 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ERI3O43414 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERI3O43414 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERI3O43414 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERI3O43414 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ERI3O43414 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERI3O43414 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERI3O43414 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERI3O43414 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERI3O43414 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERI3O43414 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERI3O43414 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ERI3O43414 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERI3O43414 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERI3O43414 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERI3O43414 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERI3O43414 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERI3O43414 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERI3O43414 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERI3O43414 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERI3O43414 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ERI3O43414 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERI3O43414 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERI3O43414 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERI3O43414 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERI3O43414 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERI3O43414 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ERI3O43414 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERI3O43414 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERI3O43414 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ERI3O43414 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERI3O43414 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERI3O43414 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERI3O43414 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERI3O43414 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERI3O43414 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERI3O43414 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ERI3O43414 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERI3O43414 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERI3O43414 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERI3O43414 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ERI3O43414 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERI3O43414 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERI3O43414 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERI3O43414 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERI3O43414 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERI3O43414 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERI3O43414 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERI3O43414 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERI3O43414 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERI3O43414 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERI3O43414 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ERI3O43414 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERI3O43414 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERI3O43414 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ERI3O43414 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERI3O43414 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERI3O43414 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERI3O43414 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ERI3O43414 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERI3O43414 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERI3O43414 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERI3O43414 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERI3O43414 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERI3O43414 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERI3O43414 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERI3O43414 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155 ms