Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
KDM6AO15550 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
KDM6AO15550 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KDM6AO15550 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms