Protein–RNA interactions for Protein: O15247

CLIC2, Chloride intracellular channel protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC2O15247 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIC2O15247 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIC2O15247 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIC2O15247 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIC2O15247 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIC2O15247 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIC2O15247 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLIC2O15247 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIC2O15247 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIC2O15247 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIC2O15247 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIC2O15247 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIC2O15247 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIC2O15247 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLIC2O15247 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIC2O15247 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIC2O15247 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIC2O15247 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIC2O15247 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIC2O15247 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIC2O15247 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLIC2O15247 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CLIC2O15247 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms