Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RIMBP2O15034 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RIMBP2O15034 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms