Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPEO14579 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPEO14579 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPEO14579 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPEO14579 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPEO14579 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPEO14579 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPEO14579 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPEO14579 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPEO14579 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COPEO14579 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPEO14579 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COPEO14579 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPEO14579 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPEO14579 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
COPEO14579 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPEO14579 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPEO14579 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPEO14579 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COPEO14579 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPEO14579 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPEO14579 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPEO14579 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPEO14579 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPEO14579 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPEO14579 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPEO14579 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPEO14579 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPEO14579 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPEO14579 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPEO14579 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPEO14579 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COPEO14579 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPEO14579 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPEO14579 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPEO14579 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPEO14579 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPEO14579 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COPEO14579 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPEO14579 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPEO14579 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPEO14579 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPEO14579 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPEO14579 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPEO14579 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPEO14579 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPEO14579 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPEO14579 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COPEO14579 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPEO14579 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPEO14579 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPEO14579 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPEO14579 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COPEO14579 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPEO14579 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPEO14579 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPEO14579 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPEO14579 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPEO14579 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPEO14579 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPEO14579 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPEO14579 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COPEO14579 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
COPEO14579 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPEO14579 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPEO14579 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPEO14579 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPEO14579 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPEO14579 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPEO14579 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPEO14579 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPEO14579 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPEO14579 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPEO14579 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COPEO14579 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COPEO14579 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COPEO14579 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPEO14579 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPEO14579 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPEO14579 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPEO14579 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPEO14579 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPEO14579 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPEO14579 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COPEO14579 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPEO14579 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPEO14579 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPEO14579 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPEO14579 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPEO14579 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COPEO14579 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COPEO14579 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPEO14579 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPEO14579 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPEO14579 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPEO14579 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPEO14579 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPEO14579 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COPEO14579 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COPEO14579 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms