Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PTPRTO14522 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
PTPRTO14522 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRTO14522 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
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