Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 MTMR4-201ENST00000323456 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.687e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 ZNF473-202ENST00000391821 4715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.691e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 HACL1-206ENST00000435217 1269 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.721e-18■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 CPVL-208ENST00000449801 528 ntTSL 410.52□□□□□ -0.731e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 MTMR4-207ENST00000582663 572 ntTSL 49.99□□□□□ -0.817e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 HACL1-205ENST00000422591 1637 ntTSL 59.95□□□□□ -0.821e-18■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 HACL1-208ENST00000456194 1880 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.841e-18■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 AL137230.2-201ENST00000555070 452 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.877e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 GBA-207ENST00000467918 625 ntTSL 58.09□□□□□ -1.117e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 ADARB1-208ENST00000462214 587 ntTSL 37.94□□□□□ -1.147e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 ZNF473-209ENST00000601364 603 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.181e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.377e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 TMEM99-203ENST00000496847 259 ntTSL 34.56□□□□□ -1.687e-10■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 LSR-210ENST00000602003 297 ntTSL 418.66■□□□□ 0.589e-23■■■■■ 44.1
DDX3XO00571 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.652e-14■■■■■ 44
DDX3XO00571 CDK2AP1-206ENST00000544658 931 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.812e-14■■■■■ 44
DDX3XO00571 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.39e-13■■■■■ 44
DDX3XO00571 ATP6V0E2-205ENST00000464683 495 ntTSL 517.63■□□□□ 0.419e-13■■■■■ 44
DDX3XO00571 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.687e-17■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.357e-17■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.247e-17■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.365e-7■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.255e-9■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 15e-9■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.975e-9■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.935e-9■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 Z98883.1-201ENST00000409439 916 ntTSL 320.7■□□□□ 0.95e-9■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 PIGQ-202ENST00000293874 603 ntTSL 419.5■□□□□ 0.715e-9■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 PIGQ-207ENST00000439574 586 ntTSL 318.46■□□□□ 0.555e-9■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.014e-12■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 NDC1-202ENST00000480952 785 ntTSL 312.98□□□□□ -0.334e-12■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 CES2-203ENST00000561697 918 ntTSL 315.62■□□□□ 0.096e-8■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 CES2-207ENST00000566182 891 ntTSL 314.15□□□□□ -0.146e-8■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 CES2-211ENST00000568470 3391 ntTSL 212.68□□□□□ -0.386e-8■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 CES2-202ENST00000417689 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.426e-8■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 CES2-201ENST00000317091 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.546e-8■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 NSA2-201ENST00000296802 1199 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.278e-8■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 NSA2-203ENST00000514918 645 ntTSL 212.22□□□□□ -0.458e-8■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 NSA2-205ENST00000610426 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.168e-8■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 NSA2-202ENST00000513356 797 ntTSL 36.36□□□□□ -1.398e-8■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 OXNAD1-203ENST00000442255 1994 ntTSL 514.76□□□□□ -0.052e-9■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.132e-9■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 OXNAD1-205ENST00000486267 675 ntTSL 214□□□□□ -0.172e-9■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 OXNAD1-206ENST00000605932 1681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.292e-9■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 OXNAD1-204ENST00000452581 960 ntTSL 1 (best)12.55□□□□□ -0.42e-9■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 OXNAD1-209ENST00000627468 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.462e-9■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 OXNAD1-201ENST00000285083 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.722e-9■■■■■ 43.9
DDX3XO00571 SLC30A9-204ENST00000510460 819 ntTSL 218.27■□□□□ 0.526e-7■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 SLC30A9-205ENST00000513699 2217 ntTSL 214.65□□□□□ -0.066e-7■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 SLC30A9-201ENST00000264451 6218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.756e-7■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 USP1-201ENST00000339950 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.354e-11■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 USP1-203ENST00000442679 502 ntTSL 212.85□□□□□ -0.354e-11■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 USP1-204ENST00000452143 893 ntTSL 310.84□□□□□ -0.674e-11■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.254e-11■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.822e-11■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 JPT2-213ENST00000569256 911 ntTSL 1 (best)18.4■□□□□ 0.542e-11■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 JPT2-211ENST00000567717 857 ntTSL 317.3■□□□□ 0.362e-11■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 JPT2-209ENST00000566742 593 ntTSL 416.58■□□□□ 0.242e-11■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.022e-11■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 JPT2-206ENST00000562684 3185 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.252e-11■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 JPT2-201ENST00000248098 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.292e-11■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.342e-11■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.52e-11■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 JPT2-210ENST00000566925 570 ntTSL 48.94□□□□□ -0.982e-11■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.79■■□□□ 1.41e-7■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 EMD-203ENST00000428228 946 ntTSL 318.93■□□□□ 0.622e-24■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 EMD-207ENST00000486738 1284 ntTSL 318.12■□□□□ 0.492e-24■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 EMD-206ENST00000485261 792 ntTSL 317.82■□□□□ 0.442e-24■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.119e-17■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.279e-17■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 AP001496.2-201ENST00000581170 607 ntTSL 510.92□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 AP001496.2-202ENST00000579933 977 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.921e-7■■■■■ 43.8
DDX3XO00571 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.423e-12■■■■■ 43.7
DDX3XO00571 ALG8-208ENST00000526737 1674 ntTSL 516.09■□□□□ 0.175e-7■■■■■ 43.7
DDX3XO00571 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.035e-7■■■■■ 43.7
DDX3XO00571 ALG8-211ENST00000527099 829 ntTSL 414.44□□□□□ -0.15e-7■■■■■ 43.7
DDX3XO00571 ALG8-201ENST00000299626 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.275e-7■■■■■ 43.7
DDX3XO00571 ALG8-210ENST00000526928 614 ntTSL 413.21□□□□□ -0.295e-7■■■■■ 43.7
DDX3XO00571 ALG8-213ENST00000530454 881 ntTSL 511.51□□□□□ -0.575e-7■■■■■ 43.7
DDX3XO00571 ALG8-217ENST00000532050 892 ntTSL 1 (best)11.51□□□□□ -0.575e-7■■■■■ 43.7
DDX3XO00571 ALG8-204ENST00000525755 838 ntTSL 310.86□□□□□ -0.675e-7■■■■■ 43.7
DDX3XO00571 ALG8-220ENST00000532552 645 ntTSL 59.95□□□□□ -0.825e-7■■■■■ 43.7
DDX3XO00571 ALG8-221ENST00000615266 1469 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.095e-7■■■■■ 43.7
DDX3XO00571 ALG8-205ENST00000525761 468 ntTSL 37.51□□□□□ -1.215e-7■■■■■ 43.7
DDX3XO00571 ALG8-207ENST00000525870 778 ntTSL 56.28□□□□□ -1.45e-7■■■■■ 43.7
DDX3XO00571 ATXN7L3-212ENST00000593073 527 ntTSL 48.51□□□□□ -1.052e-9■■■■■ 43.4
DDX3XO00571 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.171e-57■■■■■ 43.4
DDX3XO00571 PIGK-201ENST00000359130 1926 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.982e-7■■■■■ 43.4
DDX3XO00571 PIGK-204ENST00000478391 737 ntTSL 27.6□□□□□ -1.192e-7■■■■■ 43.4
DDX3XO00571 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.442e-7■■■■■ 43.4
DDX3XO00571 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.472e-7■■■■■ 43.4
DDX3XO00571 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.587e-7■■■■■ 43.4
DDX3XO00571 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.935e-12■■■■■ 43.4
DDX3XO00571 GLT8D1-203ENST00000463762 726 ntTSL 219.21■□□□□ 0.673e-8■■■■■ 43.4
DDX3XO00571 CHPF2-203ENST00000482173 548 ntTSL 419.38■□□□□ 0.693e-13■■■■■ 43.3
DDX3XO00571 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.163e-13■■■■■ 43.3
DDX3XO00571 CHPF2-201ENST00000035307 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.363e-13■■■■■ 43.3
DDX3XO00571 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.852e-8■■■■■ 43.3
DDX3XO00571 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.822e-8■■■■■ 43.3
DDX3XO00571 RFK-204ENST00000479197 1501 ntTSL 1 (best)18.8■□□□□ 0.68e-12■■■■■ 43.3
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