Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MEIS1O00470 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MEIS1O00470 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MEIS1O00470 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms