Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
O00370 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
O00370 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
O00370 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
O00370 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
O00370 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
O00370 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
O00370 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
O00370 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
O00370 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
O00370 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
O00370 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
O00370 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
O00370 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
O00370 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
O00370 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
O00370 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
O00370 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
O00370 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
O00370 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
O00370 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
O00370 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
O00370 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
O00370 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
O00370 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
O00370 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
O00370 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
O00370 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
O00370 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
O00370 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
O00370 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
O00370 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
O00370 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
O00370 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
O00370 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
O00370 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
O00370 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
O00370 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
O00370 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
O00370 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
O00370 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
O00370 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
O00370 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
O00370 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
O00370 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
O00370 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
O00370 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
O00370 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
O00370 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
O00370 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
O00370 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
O00370 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
O00370 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
O00370 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
O00370 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
O00370 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
O00370 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
O00370 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
O00370 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
O00370 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
O00370 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
O00370 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
O00370 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
O00370 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
O00370 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
O00370 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
O00370 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
O00370 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
O00370 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
O00370 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
O00370 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
O00370 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
O00370 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
O00370 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
O00370 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
O00370 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
O00370 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
O00370 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
O00370 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
O00370 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
O00370 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
O00370 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
O00370 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
O00370 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
O00370 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
O00370 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
O00370 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
O00370 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
O00370 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
O00370 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
O00370 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
O00370 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
O00370 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
O00370 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
O00370 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
O00370 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
O00370 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
O00370 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
O00370 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
O00370 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms