Protein–RNA interactions for Protein: O00311

CDC7, Cell division cycle 7-related protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC7O00311 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC7O00311 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC7O00311 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC7O00311 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC7O00311 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC7O00311 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC7O00311 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC7O00311 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC7O00311 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC7O00311 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC7O00311 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC7O00311 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC7O00311 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC7O00311 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC7O00311 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC7O00311 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC7O00311 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC7O00311 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC7O00311 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC7O00311 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC7O00311 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC7O00311 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC7O00311 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC7O00311 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC7O00311 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC7O00311 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC7O00311 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC7O00311 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC7O00311 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC7O00311 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC7O00311 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC7O00311 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC7O00311 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC7O00311 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC7O00311 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC7O00311 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC7O00311 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC7O00311 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC7O00311 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC7O00311 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC7O00311 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC7O00311 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC7O00311 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC7O00311 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC7O00311 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC7O00311 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC7O00311 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC7O00311 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC7O00311 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC7O00311 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC7O00311 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC7O00311 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDC7O00311 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC7O00311 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC7O00311 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC7O00311 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC7O00311 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC7O00311 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC7O00311 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC7O00311 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC7O00311 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC7O00311 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC7O00311 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC7O00311 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC7O00311 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC7O00311 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC7O00311 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC7O00311 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC7O00311 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC7O00311 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC7O00311 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC7O00311 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC7O00311 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC7O00311 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC7O00311 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC7O00311 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC7O00311 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC7O00311 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC7O00311 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC7O00311 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC7O00311 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC7O00311 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC7O00311 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC7O00311 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC7O00311 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC7O00311 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC7O00311 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC7O00311 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC7O00311 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC7O00311 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC7O00311 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC7O00311 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC7O00311 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC7O00311 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC7O00311 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC7O00311 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC7O00311 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC7O00311 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC7O00311 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC7O00311 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms