Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RFXAPO00287 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFXAPO00287 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
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