Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOC4-APOC2K7ER74 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC4-APOC2K7ER74 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms