Protein–RNA interactions for Protein: J3QRE1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRE1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QRE1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QRE1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QRE1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QRE1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QRE1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QRE1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QRE1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
J3QRE1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
J3QRE1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRE1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRE1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRE1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRE1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRE1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRE1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRE1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRE1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRE1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRE1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRE1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRE1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRE1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRE1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRE1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRE1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
J3QRE1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRE1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRE1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRE1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRE1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRE1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRE1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRE1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRE1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRE1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
J3QRE1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QRE1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QRE1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QRE1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QRE1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QRE1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QRE1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QRE1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QRE1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QRE1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
J3QRE1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QRE1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QRE1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QRE1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QRE1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QRE1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QRE1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QRE1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QRE1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
J3QRE1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QRE1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QRE1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QRE1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QRE1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QRE1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QRE1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QRE1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QRE1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
J3QRE1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3QRE1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3QRE1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3QRE1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3QRE1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
J3QRE1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
J3QRE1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3QRE1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3QRE1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3QRE1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3QRE1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3QRE1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3QRE1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3QRE1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3QRE1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
J3QRE1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3QRE1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3QRE1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3QRE1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3QRE1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
J3QRE1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
J3QRE1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
J3QRE1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
J3QRE1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3QRE1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3QRE1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3QRE1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3QRE1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3QRE1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3QRE1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3QRE1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3QRE1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
J3QRE1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3QRE1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3QRE1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
J3QRE1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms