Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC01387J3KSC0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC01387J3KSC0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC01387J3KSC0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms