Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CFAP99D6REC4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CFAP99D6REC4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP99D6REC4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms