Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HHLA1C9JL84 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HHLA1C9JL84 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HHLA1C9JL84 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms