Protein–RNA interactions for Protein: B3SHH9

TMEM114, Transmembrane protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM114B3SHH9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM114B3SHH9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM114B3SHH9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM114B3SHH9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms