Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HMGB1P1B2RPK0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HMGB1P1B2RPK0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms