Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PALM2-AKAP2B1ALY0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms