Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP27XA6NNY8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP27XA6NNY8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms