Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC69A6NI79 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC69A6NI79 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC69A6NI79 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms