Protein–RNA interactions for Protein: A6NGU7

LINC01546, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01546, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01546A6NGU7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01546A6NGU7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01546A6NGU7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms