Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L4A6NCW7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L4A6NCW7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L4A6NCW7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP17L4A6NCW7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP17L4A6NCW7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP17L4A6NCW7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L4A6NCW7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L4A6NCW7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L4A6NCW7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L4A6NCW7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L4A6NCW7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L4A6NCW7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L4A6NCW7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L4A6NCW7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L4A6NCW7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L4A6NCW7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L4A6NCW7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L4A6NCW7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L4A6NCW7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L4A6NCW7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L4A6NCW7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L4A6NCW7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L4A6NCW7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L4A6NCW7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L4A6NCW7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms