Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW0

USP17L3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L3A6NCW0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP17L3A6NCW0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP17L3A6NCW0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP17L3A6NCW0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L3A6NCW0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L3A6NCW0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L3A6NCW0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L3A6NCW0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L3A6NCW0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L3A6NCW0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L3A6NCW0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L3A6NCW0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP17L3A6NCW0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L3A6NCW0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L3A6NCW0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L3A6NCW0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L3A6NCW0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L3A6NCW0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L3A6NCW0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L3A6NCW0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L3A6NCW0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L3A6NCW0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP17L3A6NCW0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms