Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PSDA5PKW4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PSDA5PKW4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PSDA5PKW4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms