Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC66A2RUB6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms