Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYCE3A1L190 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYCE3A1L190 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYCE3A1L190 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms