Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRBV10-2A0A0K0K1G8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TRBV10-2A0A0K0K1G8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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