Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9Y3F1 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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