Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SCN11AQ9UI33 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms