Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0S2

COX16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX16Q9P0S2 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX16Q9P0S2 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX16Q9P0S2 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COX16Q9P0S2 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COX16Q9P0S2 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms