Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SGF29Q96ES7 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SGF29Q96ES7 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SGF29Q96ES7 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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SGF29Q96ES7 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SGF29Q96ES7 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SGF29Q96ES7 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SGF29Q96ES7 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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