Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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