Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 DBF4B-202ENST00000393547 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 PAX2-201ENST00000355243 4057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYRIPQ8NFW9 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms