Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 HORMAD1-204ENST00000368995 1794 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 C2-211ENST00000469372 1906 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 APTX-206ENST00000379825 2023 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 NEK11-213ENST00000511262 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 DAP3-225ENST00000535183 1894 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ZCWPW2-201ENST00000383768 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SLC25A19-201ENST00000320362 1651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ANKS1B-210ENST00000547446 1690 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 STRADA-227ENST00000638309 1383 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 RIC3-204ENST00000419822 1300 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AL021707.2-203ENST00000444381 1325 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 WISP1-201ENST00000220856 1205 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 MRPL27-201ENST00000225969 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 TBC1D3P3-201ENST00000342824 1080 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 DYNLT1-203ENST00000367089 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 KHDC1L-201ENST00000370388 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ATP6V1G2-206ENST00000376151 1261 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 TRAV3-201ENST00000390425 519 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 TRAV18-201ENST00000390446 440 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 CYTH4-202ENST00000402997 633 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AK4P5-201ENST00000404520 634 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 ANKRD7-202ENST00000417525 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 RPL36A-203ENST00000427805 910 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC024937.1-201ENST00000429793 344 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC005838.1-201ENST00000430712 233 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AL732372.2-201ENST00000431321 437 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC131235.1-201ENST00000433853 732 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 LRTOMT-208ENST00000439209 801 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AC093326.1-201ENST00000444079 762 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 FTLP16-201ENST00000446400 513 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 AL929472.4-201ENST00000447422 691 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
KRTAP20-1Q3LI63 SMIM10L2B-AS1-201ENST00000453528 1027 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms