Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDK17Q00537 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms