Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LMO4P61968 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LMO4P61968 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LMO4P61968 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LMO4P61968 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LMO4P61968 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LMO4P61968 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LMO4P61968 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms