Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
ACTBP60709 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
ACTBP60709 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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