Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMTNP53814 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMTNP53814 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMTNP53814 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms