Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAD52P43351 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAD52P43351 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAD52P43351 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAD52P43351 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAD52P43351 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAD52P43351 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAD52P43351 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RAD52P43351 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RAD52P43351 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAD52P43351 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RAD52P43351 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
RAD52P43351 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAD52P43351 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAD52P43351 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAD52P43351 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAD52P43351 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAD52P43351 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAD52P43351 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAD52P43351 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
RAD52P43351 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms