Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSR1P43307 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSR1P43307 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SSR1P43307 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms