Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PPARGP37231 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PPARGP37231 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGP37231 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGP37231 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGP37231 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGP37231 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PPARGP37231 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms