Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFNP31947 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFNP31947 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFNP31947 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFNP31947 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFNP31947 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms