Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 LINC01012-203ENST00000628762 743 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 KRT8P6-201ENST00000399259 1207 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
POLD1P28340 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms